omicOS 使用教程
AI4S分析工作台 —— 由多智能体 LLM 驱动，构建于 OmicVerse | SocialVerse | MatVerse 之上
这是什么
OmicOS 是一个把"大语言模型多智能体"和"AI4S"结合在一起的工作台。结合团队过往的AI4S科研经历，我们将科研分析场景中的所有环节整合到了OmicOS Bench中，帮助你将任意前沿大模型的编程，分析，思考能力，变成真实可用的科研场景的功能闭环。
依托OmicOS-Kernel的架构和记忆设计，OmicOS可以把目标、文件、Notebook、终端、变量、画布、科研可视化工具上下文、执行状态、记忆模式、PI项目管理等功能保持在同一个任务中，并保持全程可追溯，让任何AI4Bio、AI4Scoial和AI4Mat的分析从规划一路推进到实现，最后落脚于论文和科研任务。
不同于一般的Agent智能体，科研任务往往可能在多个设备上完成不同的部分，于是我们建立了任何对话归属于同一个project的PI项目管理台，打通了本地、服务器、云端多端协同互作的途径，同时也支持使用微信、qq、飞书、slack、telegram等平台同步对话。
你用自然语言描述分析意图，omicOS 的设计的智能路由Agent会自动调用 OmicVerse、SocialVerse、MatVerse 等工具和包，在一个共享的 IPython kernel 里跑出真实代码、图表和结果。
omicOS 由三个产品模块组成：
| 模块 | 地址 | 本教程对应章节 |
|---|---|---|
| omicos-core | 本地命令行 / 守护进程（Rust 二进制） | 第一部分：配置与使用 |
| omicOS UI | app.omicos.cn | 第二部分：图文操作教程 |
| omicOS Server UI | auth.omicos.cn | 第三部分：账户与服务端管理 |
第四部分主要是实际案例演示，我们希望通过一系列详细的教程指引，来帮助你更快地上手OmicOS Science：从整理数据、预处理到注释和下游分析，演示怎样在 omicOS 里完成一条工作流。
怎么读这本教程
- 第一部分 教你把 omicOS 装到自己的电脑或服务器上：安装、配置环境变量、登录云账号、在 SSH / HPC 上远程运行，以及全部命令行参数的高级用法。如果你想跑分析，从这里开始。
- 第二部分 用大量应用截图，手把手讲解 app.omicos.cn 网页端的每一个功能。
- 第三部分 用截图讲解 auth.omicos.cn 账户与服务端管理页面的配置与使用。
- 第四部分 按分析类型整理真实 use case。目前先从单细胞的数据整理、预处理和细胞类型注释开始。
📌 文档仍在持续更新。第四部分已经提供首组单细胞案例，空间转录组和 Bulk 案例将陆续补全。
三步快速上手
# 1. 安装 omicos（npm 方式，最简单）
npm install -g @omicverse/omicos
# 2. 登录云账号
omicos login
# 3. 启动并打开网页端
omicos serve
# 浏览器自动打开 https://app.omicos.cn
想了解每一步的细节、其他安装方式、以及服务器场景，请进入 第一部分。