Bulk 分析
Bulk RNA-seq 记录一份组织或细胞群体的整体基因表达。根据研究问题，我们可以比较基因表达、分析通路变化，也可以估计肿瘤微环境中的细胞组成，并结合临床或基因组数据继续探索。
Omicos 中有多个 Agent 可以参与 Bulk 分析。本目录按 Agent 组织教程，便于你找到适合当前问题的分析流程。
选择教程
| Agent | 这套教程解决什么问题 | 案例数据 |
|---|---|---|
| iobrx Analyst | 从 RNA 数据准备到肿瘤微环境（TME）分析与建模，用八次对话完成八个板块 | 412 例 TCGA-STAD 原发肿瘤；建模使用 IMvigor210 队列 |
在 iobrx 教程中，你向 Omicos 的 iobrx Analyst 提出问题，Agent 根据配套 Skill 选择方法，调用 iobrx harness 和分析工具完成计算。每章给出简单问法、实际结果和读图方法；版本与运行记录见数据与运行说明。