6. 工具页(Tools)

点左侧图标栏的 工具,进入工具页。这里是一组交互式查看器与工作台。以标签页方式打开,切换标签时分析继续在后台跑,不会被打断。

工具页分两层:

  • 主页:卡片网格,列出当前领域可用的全部工具。
  • 标签页:打开过的工具排成一条标签栏,每个都能单独关闭。「主页」始终是第一个标签,随时点回去再开别的。
1卡片网格选工具› 2以标签页打开› 3与对话共用内核 切换标签不打断分析

每个工具都是单例。已经开着的工具再点一次卡片,只会切回那个标签,不会开出第二份(ImageJ 引擎、画布会话这类不该被复制)。

6.1 卡片网格与领域

卡片按领域过滤。生命科学(omics)与人文社科各有各的工具,只有当前领域的卡片会出现在网格里。切换领域后,不属于新领域的已开标签会自动关闭。领域在顶栏切换,见 1. 概览。

画布是唯一两个领域共用的工具。

6.2 生命科学领域的工具

工具 做什么
细胞查看器 交互式 AnnData 细胞与降维查看器
ImageJ 浏览器内完整 ImageJ,可用宏驱动
HE查看器 H&E 全切片图像查看器,支持真正的深缩放(分块加载,可看到细胞级)
分子查看器 3D 分子结构查看器
Motif 分子生物学工作台——克隆、质粒图谱、CRISPR
Sanger 测序色谱图查看器——验证克隆、从 .ab1 读出编辑结果
Cytometry(流式细胞) 对 .fcs 样本设门——可以自己画门,也可以直接描述你想要的门
画布 在画布上微调并重绘图表

Sanger 与 Cytometry 是内核驱动的。.ab1 由 ov.alignment.read_ab1 在内核里解析,.fcs 由 ov.io.read_fcs 解析。结果镜像到内核变量(_omicos_sanger / _omicos_flow),标签页只负责画。这样智能体和你操作的是同一份数据。流式的门控策略也镜像成 _omicos_flow_gs,你用鼠标画的门和智能体改的门是同一棵门控树,不会各改各的。

Motif 需要先连上 MCP 服务器。它包着 motif 这个 MCP 服务,打开时先检查服务器是否就绪。没装的话会把你带到 MCP 设置页,见 10. 设置。

6.3 人文社科领域的工具

工具 做什么
透视表 对表格数据做透视与交叉分析
关系网络 构建并探索网络图
质性编码 质性编码工作台
历史地图 在历史地图上绘制数据
手稿 撰写并组织论文手稿
画布 同上(两领域共用)

6.4 MCP 应用工具

除了内置工具,MCP 服务器还能提供 ui:// 形式的应用。它们同样以标签页形式挂在工具页里,和内置工具一个用法。这类工具由服务端的 MCP 目录提供,装了对应服务器就会出现。

6.5 与对话联动

工具不是孤立的。在对话里让智能体做的事,可以直接交接到工具标签里继续(例如让它读一个 .fcs 然后在流式标签里接着看门控)。反过来,你在工具里的操作也写回内核变量,智能体下一轮就能读到。

"内核驱动"是这些工具区别于普通查看器的地方

Sanger 与流式细胞的数据由内核解析(ov.alignment.read_ab1 / ov.io.read_fcs),结果镜像成内核变量,标签页只负责画;门控策略也镜像成 _omicos_flow_gs。

所以你用鼠标画的门,和智能体改的门,是同一棵门控树——不存在"界面上调好了但代码里是另一套"的分叉,门控结果可以直接被后续分析代码读到。

下一步:内核与运行时监控。

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