在画布中编辑图片:框选要改的位置,再重新作图

1. 这一步在做什么

前四步已经完成数据整理、预处理、注释和常规画图。如果图的数据没问题,只是配色、线条、字体或布局需要调整,可以继续在画布中修改。

操作只有三步:

打开结果图
→ 框选要改的位置
→ 输入要求并重新做图

这一步不用新建对话,也不用重新激活智能体。画布会续接原图所在的分析对话。

画布不是直接修改 PNG 像素。omicOS 会尽量找到原数据、作图代码和运行环境,再生成一张新图。只有图片、没有可追溯的数据或代码时,不能靠像素准确猜回数值。

2. 先学会怎么用

2.1 打开结果图,进入画布

分析完成后,可以从结果文件或工作空间文件列表中打开 PNG。右侧出现“历史追溯”后,点击“在画布中编辑”。

从分析结果或工作空间文件进入画布编辑

可以从分析结果或工作空间文件列表打开图片,再点击“在画布中编辑”。截图已遮挡内部路径。

只有能追溯到原分析回合的图片,才会显示这个入口。画布中的 AI 重新作图需要 Plus 或以上权限。

2.2 框选局部,也可以框选整张图

进入画布后,默认使用“框选”。拖出一个矩形,告诉 omicOS 重点修改哪里。

在画布中框选需要修改的局部区域

可以只框标题、图例或某个子图;整张图都要重绘时,也可以框选全图。点击查看大图。

框选只是定位,不是裁图。omicOS 仍会基于原数据和代码重新生成完整图片。

如果修改要求依赖颜色、文字重叠等视觉细节,可以打开“让模型看图”。普通的数据重绘通常不需要打开。

2.3 输入要求,点击“重新做图”

在底部说明要改什么,再点击“重新做图”。

输入修改要求并点击重新做图

写清修改目标后提交。完成后,手动返回“分析”页查看新回复和新文件。点击查看大图。

如果结果仍有问题,可以继续框选、继续描述、再次重新做图。每一轮都应保留旧图,并生成新文件用于对照。

3. 真实案例:同一张图连续优化两次

上面三张操作图演示的,就是下面这个连续优化两次的例子。

这个案例来自上一页的简单差异表达分析。图中比较 Ureter 的 TILC 在男性和女性供体(donor)中的表达。

3.1 原图

画布编辑前的十二个候选基因样本级表达图

原图按 |log2FC| 展示 12 个候选基因。每个点代表一个 donor,但图中没有 p 值,配色和线条也比较朴素。点击查看大图。

3.2 第一次重新做图:补 p 值并统一样式

第一次框选整张图,输入:

这个图要标明p值,且需要美化颜色和线条,要求是简洁美观的CNS质感

第一次结果如下:

第一次重新绘制后带 p 值和新配色的表达图

第一次重新做图加入了 p 值和显著性标记,也统一了颜色和线条。点击查看大图。

这次修改不只是“美化”。它还新增了 Mann–Whitney U 检验,因此必须核对:

  • 比较单位是否真的是 donor,而不是单个细胞;
  • Male 和 Female 的样本数是否正确;
  • 检验方法是否适合研究设计;
  • 12 次比较是否需要做多重校正。

截图标题写着 Top 12 DEGs,但其中多个基因标为 ns。更准确地说,它们是按 |log2FC| 排名前 12 的展示基因,不能把 12 个都称为显著差异基因。

第一次结果还有一个明显问题:主标题、副标题和部分基因名发生了重叠。

3.3 第二次重新做图:只修文字重叠

这次不需要改整张图。框选标题区域,输入:

这部分文字重叠了,调整一下

框选重叠文字并提交第二次重新作图

这张截图记录的是第二次修改请求。第二轮只要求调整标题布局,不应改变数据点、坐标、p 值或检验结果。

第二次重新作图的结果如下:

第二次重新绘制后修复标题重叠的表达图

第二次结果拉开了主标题、副标题和各基因标题的间距,文字不再重叠。点击查看大图。

从图面上看,数据点、坐标和 p 值标注保持不变。但正式使用前,仍要与第一次结果或原始结果表逐项核对。

这个例子说明:第一次结果不一定就是最终结果。发现重叠、裁切或图例遮挡后,可以继续进行下一轮小范围修改。

4. 提示词怎样写

“CNS 质感”可以说明大致方向,但最好再写出可以检查的要求。

可以套用这个短模板:

把【框选区域】改成【明确目标】。
保持【数据、分组、顺序、坐标、单位和统计结果】不变。
基于原数据和代码重新作图,另存为新文件,不要覆盖原图。

常见写法:

想解决的问题 可以这样说
文字重叠 增加标题、副标题和子图标题的间距,其他内容保持不变
字太小 放大标题、坐标轴、图例和数值标签,避免裁切
配色不清楚 使用色盲友好配色,保持类别和颜色一一对应
线条太乱 统一线宽、边框和误差线,保持数据点和坐标不变
图例挡住数据 把图例移到图外,保持绘图区和坐标范围不变
添加 p 值或 q 值 使用原数据或结果表,说明比较单位、检验方法和多重校正

5. 什么可以交给 omicOS,什么必须自己确认

分析者负责 可以交给 omicOS
说明这张图要表达什么 找回可追溯的原对话、代码和数据
明确哪些内容允许改 根据框选位置调整字体、配色、线条和布局
确认样本单位、统计方法和多重校正 在证据足够时添加统计标注
核对数值、分组、单位和坐标 重新生成图片并保存新文件
判断新图能否用于报告或论文 在证据不足时提示需要补充数据

画布可以改善图的表达方式,但不能替代统计设计和生物学判断。

6. 结果怎么检查

每次重新做图后,至少核对:

  1. 数据点、箱线、柱高或格子数值是否与原结果一致;
  2. 分组、类别顺序和颜色对应是否被改变;
  3. 横纵轴范围、单位和对数尺度是否正确;
  4. p 值、q 值、显著性符号和检验方法是否匹配;
  5. 是否需要多重检验校正;
  6. 文字是否仍有重叠、裁切或图例遮挡;
  7. 新图是否另存,原图是否仍可用于对照。

图更漂亮,但数值、方向或统计方法对不上,仍然不能使用。

7. 下一步

画布适合把已经完成的分析结果讲得更清楚。需要改变分析问题或重新计算时,应返回常规画图与简单差异表达

想回看完整路线,可以返回单细胞分析导读

8. 其他重新绘图案例

下面再看三个例子。操作方法相同:打开原图、框选整张图、输入修改要求,再检查新图。这里重点看“原图和结果有什么变化”。

8.1 细胞组成图

原图:

不同组织细胞类型组成堆叠柱状图原图

输入的提示词:

对这个图的进行美化,要求高级美观的CNS质感

优化后:

重新绘制后的组织细胞类型组成图

新图调整了配色、留白和图例,并在主要色块中加入百分比。使用前仍要核对各组织的类别顺序、比例和纵轴刻度。

8.2 组织两两比较热图

原图:

不同组织两两比较 q 值热图原图

输入的提示词:

对这个图进行美化,部分文字太小看不清,配色需要美化,要CNS质感

优化后:

放大文字并调整配色后的组织比较热图

新图放大了标题、组织名称和格内数值,并统一了蓝色系配色。正式使用前,要逐格核对 q 值、显著性符号和色条范围。

8.3 差异基因数量图

原图:

不同细胞类型和组织的差异基因数量柱状图原图

输入的提示词:

美化这个图,要CNS质感

优化后:

重新排版并标注数值后的差异基因数量图

新图按细胞大类分区,增加柱顶数值,并调整配色和图例。使用前要核对每根柱子的方向、数值和对应组织。

这三个案例说明,“美化”可以改变配色、字体、布局和标注,但不能默认新图一定正确。每次重新绘图后,仍要和原图或结果表逐项对照。

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