分析操作案例与指南
这一部分按分析类型整理实际操作案例。现有五篇教程属于“单细胞-上游分析”；“单细胞-下游分析”已经加入亚类注释前准备、细胞亚类注释、通路富集评分、基因调控网络、代谢分析、轨迹分析和 3CA 元程序分析教程，其他方向将陆续更新。
教程目录
- 单细胞-上游分析：数据整理、预处理、细胞类型注释、常规画图与简单差异表达，以及在画布中编辑图片。
- 单细胞-下游分析：从大类注释结果继续，按大类拆分 h5ad，完成谱系内亚类注释，并学习通路富集评分、基因调控网络、代谢分析、轨迹分析和跨样本 3CA 元程序分析。
- Bulk 分析：即将更新。
- 空间转录组分析：即将更新。
案例中的路径和运行标识已经泛化，分析数字与图片来自对应的真实运行记录。它们用于演示工作方法，不是可以机械套用到所有数据的“标准答案”。